慢性腹泻的发病机制主要有四个方面：第一是渗透性腹泻，最常见的是肠镜检查使用的西药聚乙二醇，这种腹泻的特点是只要禁食这类东西，腹泻就会停止。第二是分泌性腹泻，分泌性腹泻最典型的例子是霍乱，这种腹泻的特点是患者即使禁食水，患者腹泻也不会不停止，因为它是分泌性的，患者很快会出现血容量大量丢失，出现低血容量休克的表现。第三是渗出性腹泻，主要是肠道黏膜炎症表面渗出导致腹泻，特点是大便带有黏膜渗出物、有血。第四是肠动力异常，主要是肠蠕动加快导致的腹泻，特点大便成形，没有黏液、没有血。