附件囊肿对月经是有一定的影响的，妇科疾病都会对月经有或多或少的影响，虽然附件囊肿是一种良性的肿瘤，但是还是会可能导致女性月经不调。对内分泌紊乱病人，如植物神经功能紊乱、甲状腺功能异常、肾上腺功能异常等导致的内分泌紊乱，在治疗附件囊肿的同时，应当针对这些原发病积极治疗。