胃肠镜检查相对来说并没有什么太大的痛苦,一般都在患者可以耐受的范围。肠镜检查过程当中,因为肠子是瘪的,需要充气进去才能看清楚肠粘膜的病变,所以在充气的过程当中,患者会有腹胀的感觉,而肠子是弯曲的,在长镜经过弯曲的肠段的时候,患者会有一种剧烈疼痛的感觉,而这种疼痛的程度因人而异,如果患者对疼痛耐受性比较好的话,可能不会觉得太痛苦,如果平时比较怕疼,就是痛觉比较敏感的就会觉得非常的痛苦。结肠镜的检查可能会引起腹部疼痛的情况,但是一般来说都在可以耐受的范围,肠镜的检查还是肠道最好的检查的方式,可以了解肠道有没有肠息肉,有没有肠炎或者是有没有肠道肿瘤的情况。