肠系膜静脉血栓通常累积肠系膜上静脉，而肠系膜下静脉很少受累。急性肠系膜上静脉血栓形成的临床表现多有腹痛，腹部不适，排便规律的改变等等这些前驱的症状。在此期，患者的症状不典型查体也没有明显的体征，仅表现为不确定的腹部深压痛。各项化验还有辅助检查，也没有特异性的变化。此时诊断，肠系膜上静脉血栓形成很困难。随着本病进入进展期，病情发展会明显加快，患者的症状多会突然间加重。腹痛会剧烈常呈持续性，但是定位也不确切。一般的止痛药物一般是没有效果的，通常需要进行强镇痛剂比如说杜冷丁或者说吗啡才能暂时的缓解。同时伴有腹胀、恶心呕吐。进展早期患者症状明显加重，但是体征比较少。如果说在早期，常没有明显的肌紧张压痛、反跳痛等，这些腹膜刺激征随着往后肠管缺血容易导致肠管水肿渗出，从而激发腹膜炎。会出现相应的体征。
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