右侧附件囊肿的治疗主要以手术治疗为主，一侧附件是指的一侧输卵管、卵巢组织再次组织出现了囊肿，一般需要通过手术的方式将囊肿清除，并且通过后续的病理检查了解囊肿的良、恶性质，然后决定后续的治疗。
部分生理性的囊肿可以适当的观察，有可能自行消退。如果囊肿持续时间在3~6个月以上，并且逐渐增大，尤其是大于5厘米时，则以手术治疗为优先的治疗方式，药物治疗的效果并不确切，并且囊肿的性质无法进一步的明确。
在进行手术治疗之后，通常会进行病理检测，病理检测的目的是为了对性质进行进一步的判断，了解其是否后续治疗以及复发的可能性。
