大多数肛周脓肿是可以治愈的，但有复发的可能，有的无法根治。一般在没有形成脓肿之前，可遵医嘱应用抗生素抗感染治疗，或局部外用抗感染药膏，基本上可以治愈，但后期如果不注意卫生，就有可能导致感染加重，形成脓腔。一旦形成脓肿，需尽早切开引流，大部分患者在手术之后可以痊愈，但大概40%~50%的患者会有复发的可能，而且大多数发生于初始治疗后的一年当中，往往需要再次手术。若是不及时处理，可能会并发肛瘘或者是脓毒症，有的还会出现坏死性筋膜炎，会导致患者休克或死亡。

通常肛周脓肿疼痛级别在8级左右，具体因人而异。在临床医学上，肛周脓肿引起的明显症状就是局部疼痛，因为每个人对痛感反应不一样，所以目前并没有统一的标准。目前疼痛级别有10个等级，具体划分为4个区段，若痛感是1~3级，患者会自觉肛门出现疼痛或不适。若痛感是4~7级，肛门疼痛往往比较明显，但大多可耐受，一般无需药物治疗；痛感处于8~10级，会有明显的肛门疼痛，需要用药缓解，有些人疾病用药也无法缓解，需要肌肉注射镇痛药物才有效。但对于此病，一般在切开引流之后疼痛会缓解。

当肛周脓肿的患者确诊以后，如果没有及早地进行手术治疗，是非常容易出现病情复发的现象。肛周脓肿最主要的治疗方案还得通过手术改善。如果在早期发作的时候，患者采用保守治疗或者不给予治疗，那么很大程度会导致后期，出现局部脓腔反复性感染的现象发生。每次感染的时候会有肛门局部的疼痛感觉，甚至还会由于局部脓腔反复破溃，而形成的肛瘘现象。所以为了避免病情进一步的恶化，或者存在复发的可能，建议可以在肛周脓肿确诊之后尽早的进行手术，从根本解决问题，避免复发的可能性。

在临床上没有肛肠囊肿一说，只有肛肠脓肿，所谓的肛肠脓肿是指坐骨直肠肛管周围软组织感染所形成的。肛周脓肿根据其疾病的急骤，或者说疾病的快慢通常分为直肠肛管周围间隙感染脓肿期或者说肛周脓肿以及肛瘘。肛周脓肿通常是直肠肛管周围间隙感染的急性期。而肛瘘作为直肠肛管周围间隙感染慢性期。对急性期来说，通常表现为肛周部红肿疼痛，甚至会伴有畏寒发热等全身症状。治疗上一般来说需要及时的抗生素治疗。同时对脓肿形成需要及时的行脓肿切开引流，必要时置管持续负压吸引，对于肛瘘形成由于属于慢性期，迁延不愈，在临床治疗上，一般来说，控制感染，同时需要肛瘘挂线。才能够获得治愈，而对于复杂性肛瘘通常需要。行两次以上的才有可能获得治愈。

肛周脓肿顾名思义就是肛门皮肤或者是皮下组织发生的一些化脓感染性的疾病，它的表现就是局部的疼痛、化脓，查体时候，病人会有发烧，白细胞增高或分类增高一些炎症性的表现。一旦知道自己是肛周脓肿以后，第一点，应该吃一些消炎药，控制细菌的进一步的发生和感染。第二点，可以吃一些消肿止痛的药物，对症处理，减轻患者局部的疼痛和不适感。第三点，可以给一些中药用来局部坐浴、泡洗、熏洗，一方面促进肛门周围的组织的血液回流，加速它的炎症吸收。如果，比较轻的肛门脓肿，经过上述的治疗是完全可以痊愈的。但如果保守治疗几天无效，要抓紧到医院去就诊，进一步的输液、做引流或做其他手术。