小儿支原体肺炎自然病程一般数天至2到4周不等。多数在8到12天左右退热，恢复期需要1到2周，X线阴影完全消失会比症状更延长2到3周左右，偶可见复发。小儿支原体肺炎，如果没有严重的变化，大约在15天左右能够痊愈。约20%的患儿会有其系统的表现，比如皮肤粘膜系统、心血管系统、血液系统、神经系统、消化系统，约在起病两天到数周。小儿的支原体肺炎的治疗与一般的支原体、一般肺炎的治疗原则基本相同，采用综合治疗方法，包括一般治疗、对症治疗、抗生素、肾上腺皮质激素及肺外并发症的治疗等。可以选用大环内酯类药物，比如阿奇霉素为治疗首选，还有红霉素、林可霉素，甚至磺胺。如果没有严重的并发症，抗生素应该用十天左右的时间。

小儿支原体肺炎比较严重。小儿支原体肺炎，又称原发性非典型性肺炎，往往冷凝及试验阳性，为非典型肺炎中的一种。是由支原体感染引起的，呈间质性肺炎和毛细支气管炎的改变，占儿童社区获得性肺炎的10%到40%。肺部病变呈融合性，支气管肺炎、间质性肺炎伴支气管炎。肺泡有少量炎性渗出物，可发生局灶性肺不张、肺实变，临床表现为顽固性剧烈咳嗽的肺部炎症。支原体肺炎是儿童期肺炎和其他呼吸道感染的重要病原体之一。支原体肺炎的话，还可以引起：扁桃体炎、中耳炎、毛细支气管炎。学龄期的儿童往往患肺炎，它的潜伏期一般是在2到3周，症状轻重不一，大多起病不急。发热、厌食、咳嗽、畏寒、头疼等。主要是以发热和咳嗽为主要表现。往往为干咳，有时候有少量血丝有痰。这个重症病者可并发胸腔积液、肺不张，少数病情发展迅速，可出现呼吸窘迫甚至死亡。

首先肺炎根据病程分为急性肺炎、迁延性肺炎和慢性肺炎。急性肺炎是指病程在一个月以内的肺炎，介于一个月到三个月之间的肺炎叫迁延性肺炎，如果肺炎的病程超过三个月就叫慢性肺炎。一般支原体感染的肺炎的病程是2到4周，经过抗生素规范治疗后一周以后若仍然存在发热、咳嗽、胸痛、胸闷等临床症状，胸片检查提示疾病进行性进展，一般提示难治性支原体感染性肺炎，治疗疗程一般在四周以上。

首先应该明确咳嗽对人类来说是一个保护性反射，可以咳出气管内的异物和分泌物，对人体来说是有益处的。小儿轻微咳嗽可以不用干预，但是严重的频繁的咳嗽影响患儿休息的时候应该干预咳嗽。咳嗽是呼吸系统的主要表现之一，但是并不是只有呼吸系统疾病表现出咳嗽，因为肺淤血可以出现咳嗽，口服卡托普利也可以引起药物性咳嗽，肿瘤压迫气管也可以引起咳嗽，如果支气管有异物也可以引起咳嗽。感染之后气道出现高反应，也可以出现咳嗽。所以小儿患支气管肺炎或支原体肺炎长期咳嗽不好，应该重新询问病史、查体，完善相关检查，如胸部ct、肺功能检查、支气管扩张试验、PPD试验，除外患儿是否存在肿瘤、结核菌感染、气道高反应哮喘或咳嗽性变异性哮喘。

支原体肺炎的预防应该避免去超市和电影院等人群密集的地方，尽量避免和成人和有支原体感染的患儿接触。支原体是一个介于病毒和细菌之间的致病微生物，在人体内可以分离出十六种，其中五种对人体是可以致病的。肺炎支原体是导致小儿患支原体肺炎的主要病因，可以通过飞沫和密集接触传播，可以引起小儿以肺间质为主要病变的肺部急性感染。如果幼儿园或者学校爆发了支原体肺炎，要及时隔离治疗患病的儿童，保护正常儿童。