胚胎停止发育与胚胎染色体异常、母体有全身性疾病、内分泌异常、接触有害物质以及子宫发育异常等有关。
一、胚胎停止发育，大部分是胚胎染色体异常导致，其中包括染色体结构异常、染色体倍数异常。染色体结构的异常，多见于染色体断裂或缺失，染色体数目异常，多见于胚胎三体或三倍体等；
二、若母亲患有比较严重的全身性疾病，也会导致胚胎停止发育。如有高热、全身性感染，疾病感染到胚胎导致胎停育；
三、内分泌异常也会导致胎停育，如严重糖尿病。血糖没有控制好，也容易导致胎停育发生；
四、怀孕期间母体接触有害物质，如抽烟、喝酒、吃吗啡或海洛因毒品等，也容易导致胚胎停止发育；
五、子宫发育异常，导致胚胎在子宫腔里面无法着床发育，也会导致胎停育。