早上咳黄痰，主要是这个痰的性状是黄色的，还是提示患者有细菌感染，接下来就需要考虑感染的部位在哪，要看患者的症状，因为呼吸道任何部位的炎症，都可能会出现这种黄痰或者黄色的分泌物，从上到下看，比如鼻炎、鼻窦炎，特别是慢性鼻窦炎，可能根据体位的改变导致分泌物的流出，沿着鼻炎管流到咽部，这样晨起的时候可能会有黄痰，包括一些慢性的咽炎或者扁桃体炎，局部可能也有一些脓性的分泌物。
还有一个就是气道，下气道的感染，像最常见的有一些慢性支气管炎和支气管扩张等等这类的疾病，如果晨起有咳嗽、咳黄痰的情况，可以根据病情，结合疾病的症状、表现形式，诊断是鼻炎、鼻窦炎，还是咽炎或者气管炎，或者支气管扩张等等，然后根据诊断再予以对症的治疗。
可以选用一些抗生素，像口服的最常见的头孢、左氧、大环内酯类都可以选择，当然各种选择还略有区分的。像头孢类抗生素，避免应用在对青霉素或者头孢过敏的患者身上，左氧是18岁以下的青少年避免应用，阿奇是个抑菌药，并不是像上面两种药物是杀菌药，所以相对来说抗感染的力度比较弱，然后还有一定的胃肠道的反应，如果上述两个相对来说无法选择的话，也可以选择大环内酯类，同时在抗感染的基础上，也建议加用一些排痰药，让这个痰液好咳出。