甲状腺结节的危害不可以一概而论，轻者不会有什么危害，但如果恶性病变，会造成终生甲减，甚至会威胁生命。因此甲状腺结节的危害，结节性质不同，其大小体积不一样，其危害程度也是不一样的。
对于良性的甲状腺结节，体积小的一般不会有明显危害，体积大的最多会有局部的压迫症状，引起局部憋闷，咽喉部异物感等，如果产生压迫症状可以通过手术的方式解决。
如果甲状腺结节是一种恶性病变，比如甲状腺癌，其危害程度和良性结节相比会有明显增加，如果单发的没有转移的甲状腺乳头状癌，可以采用手术，甚至现在超声消融的方式解决，对甲状腺功能的影响也不大，不容易造成终生的甲减。如果甲状腺癌伴有淋巴转移，往往需要甲状腺全切或者次全切，此时可能会造成终生的甲减，需要长期服用甲状腺素进行控制甲状腺功能。如果甲状腺结节最后确诊是甲状腺未分化癌，比如甲状腺髓样癌，这是一种恶性程度很高的甲状腺癌，生存周期很短。另外，甲状腺髓样癌还是多发内分泌腺瘤的一种表现形式，是一种具有家族性的内分泌疾病，除甲状腺髓样癌，还有肾上腺、甲状旁腺等系统的疾病，需要进行全面的检查。