女性体内的孕酮低，可以有多种原因引起。如果在黄体期血孕酮水平低于正常值。那么这种情况都提示患者的黄体功能不好。这样的患者一般会表现为月经经期的延长。正常女性来月经3~7天。黄体功能不全的女性来月经的时间可能要7~10天。而且这样的女性往往月经周期缩短。正常女性是28天左右来一次月经。这样的女性，有的时候可能22~23天就来一次月经。
另外有好多的疾病也会导致女性体内的孕酮水平比较低，比如说原发性的或者是继发性的闭经，以及功能性子宫出血。尤其是无排卵性的出血，这种情况也会导致孕酮水平的下降。还有就是多囊卵巢综合症的患者，这样的患者由于体内的雄激素水平比较高，卵泡刺激素和黄体生成素的比例失调，从而导致了孕酮水平下降。另外，长期口服避孕药也会导致孕酮水平的下降。