胆管炎的病因最主要的就是胆管结石，胆管结石在临床上比较常见，结石可以堵塞相应的胆管，结石可以是肝外胆管结石也可以是肝内胆管结石。如果是肝外胆管结石，就是在肝脏整个的胆道系统的胆汁排泄路径均有被堵塞，同时结石在胆道系统里又是异物，属于比较脏的一类东西，容易诱发胆管炎的发作。
但是结石并不是胆管炎诱发的唯一因素，虽然它是最常见的诱因，但不是胆管炎发作的唯一因素，任何原因引起的胆道梗阻或者胆管狭窄都有可能导致胆管炎的发生。比如有肿瘤、肝内胆管的肿瘤、肝外胆管的肿瘤，胰腺的肿瘤，包括十二指肠壶腹的肿瘤，都有可能引起胆道的梗阻，同时诱发胆管炎的发生，同时一些其他的良性的胆管炎性疾病，比如自身免疫性胆管炎，也可能会导致胆管的狭窄从而导致胆管炎的发生，但是不同的原因导致的胆管炎，疾病的严重程度可以不一样，比如结石它导致的胆管炎可能病情就会比较严重，如果不及时进行胆道的引流，有可能会导致严重的感染性休克的发生。