尿道下裂症状主要有异位尿道口、阴茎下弯、包皮异常分布及排尿时尿液溅射。异位尿道口，可出现在正常尿道口近端至会阴部尿道的任何部位。阴茎下弯：阴茎向腹侧弯曲，不能正常排尿和性生活。包皮的异常分布：阴茎头腹侧包皮因未能在中线融合，故呈Ｖ形缺损，包皮系带缺如，全部包皮转至阴茎头背侧呈帽状堆积。排尿时尿液溅射。
尿道下裂依尿道口解剖位置可分为４型：阴茎头型：尿道口位于冠状沟的腹侧，多呈裂隙状，一般仅伴有轻度阴茎弯曲，多不影响性生活及生育；阴茎型：尿道口位于阴茎腹侧从冠状沟到阴囊阴茎交接处之间，伴有阴茎弯曲；阴囊型：尿道口位于阴囊部，常伴有阴囊分裂，阴茎弯曲严重；会阴型：尿道外口位于会阴部，阴囊分裂，发育不全，阴茎短小而弯曲，常误诊为女性。