婴儿在宫内如果受到了感染以后，要根据感染的病原体类型，才能够知道是否能治疗，是否能康复。为了避免婴儿受到宫内感染，女性在怀孕的早期，就要积极的进行检查，可以尽早的发现婴儿被感染的病原体。
如果不是一些传染性疾病，在早期发现的时候，尽快的治疗，可以有治愈的可能。但是有一些传染性疾病，治疗的可能性不大，甚至在婴儿出现以后，仍然会有各种病毒，宫内病毒的感染，目前尚没有特效的治疗，主要是以对症、支持治疗为主。对有严重症状的巨细胞病毒感染，抗病毒药物，比如更昔洛韦、阿糖胞苷、阿糖腺苷以及阿昔洛韦，对巨细胞病毒均能起到短暂的抑制作用，而使症状缓解，但是他不能清除感染。
更昔洛韦是一种新型的核苷类抗病毒药物，但是它存在着骨髓抑制、神经毒性，以及肝肾功能损害等不良反应，这些药是否用于婴幼儿及新生儿，目前是有争议的。但是多数人认为，更昔洛韦治疗巨细胞病毒感染疗效肯定，且不良反应少，特别是对先天性巨细胞病毒感染者，无论有无症状，均应进行巨细胞病毒感染的治疗。但是如果病毒已造成了胎儿的损害，最好是尽快的终止妊娠。