确诊甲肝需至少有两个检查，一个是肝功能要明显异常，还有甲肝抗体，igm是阳性的，结合临床患者有相应的症状。乏力食欲下降，眼黄尿黄表现，就可以确诊甲肝了。
当然有患者是得甲肝后没有症状，甲肝有很多隐匿感染的尤其是成年人，如果临床症状很轻，但有甲肝的抗体的igm阳性，肝功能明显异常也是可以做确诊的。但作为甲肝，一种急性的病毒性肝炎，他的肝功能异常是非常明显的。
其它原因导致的明显的肝功异常，比如乙型肝炎、丙型肝炎、酒精性肝炎、药物性肝炎，巨细胞或eb病毒的肝炎自身免疫性肝炎等，都是在病因上需做鉴别诊断的项目都是需查的。另外还需查病情是否严重方面的项目，要查腹部的超声看看有没有肝脏的肿大，有没有慢性肝炎的基础，有没有脾大，浮水等等。也需查安全性的指标，比如肾功能因为要输液，要考虑药物的代谢，还有凝血功能来判断肝脏损伤的轻重情况，血尿便常规等需查的。
有的甲肝有发烧的，所以也要有发烧患者，要查发热的方面的鉴别诊断的项目。另外在确诊甲肝项目中，甲肝igm抗体是必须有的，需鉴别的有患者有甲肝抗体的假阳性，比如类风湿关节炎患者就可以有甲肝抗体的假阳性，这需结合临床来做鉴别。