丙肝的治疗主要聚乙二醇干扰素联合利巴韦林的治疗。
这两种药物本身的不良反应相对来说都比较严重，不良反应的方向也不完全相同，另外就是药物的联合治疗的选择方案，总体有效率也就达到70%左右，但是随着2012年左右这样的一些新的小分子化合物的逐步上市，这些丙肝药物的组合应用使得丙肝治疗的有效率，从70%的干扰素有效率提高到90%，甚至到95%以上，所以有效率得到了一个质的提升。
丙肝治疗的药物，现在可选的范围也是比较多的，所以现在可以根据患者的不同基因分型，还有他疾病发展的不同阶段，比如是1b型或非1b型，或者有肝硬化或没有肝硬化，通过这些相关检测来判断治疗方案，还有治疗周期的选择。
对于一些特殊的基因型或者特殊的疾病状态的患者，可能要采取一些加强治疗的措施，也可以使它的有效率能够得到非常明显的提升。