尿道结石可能会出现尿道感染、发热、菌血症、脓毒症、感染中毒性休克、尿潴留、肾脏积水、肾功能受损、肾功能衰竭、尿道慢性炎症、尿外渗、尿道瘘口、肿瘤等并发症。
一、尿道结石容易引起尿道感染，结石堵塞尿道后，尿液排出不畅，各种异物刺激容易继发细菌感染，产生脓性分泌物通过尿道外口流出。炎症重者细菌会通过尿道黏膜进入血液，引起发热、菌血症甚至脓毒症，严重者可能出现感染中毒性休克甚至威胁患者的生命。
二、尿道结石堵塞尿道后，患者排尿时疼痛明显或者因尿道堵塞出现排尿困难，甚至无法排尿，称之为尿潴留。膀胱内压力高甚至可以导致肾脏的积水，甚至肾功能受损，如果不及时处理会形成肾功能衰竭。
三、尿道结石长时间对于尿道内可引起尿道慢性炎症。炎性病变可以导致尿道狭窄，结石刺激尿道继发感染病可发生尿外渗；尿道损伤破裂后尿液进入尿道周围组织，尿道周围继发脓肿可以引起尿道瘘口，可以穿透皮肤漏尿；结石对尿道的长期刺激会使尿路上皮发生变化，可能会引发肿瘤。
尿道结石可以引起较重的临床症状和多种并发症，应及时进行治疗。