胃蛋白酶原1是常见的胃蛋白酶的一个成分，和2一起合成胃蛋白酶原。这个胃蛋白酶原1是胃底腺、粘液颈细胞分泌，它是主细胞分泌的，所以往往胃酸高的病人，胃蛋白酶原1也会相应的增高，所以在高胃酸分泌状态的一些病人，这个酶就是高的。所以结合起来来判断，如果胃蛋白酶原1降低了或者说同时伴有胃蛋白酶原2升高了，这就说明胃酸水平低，可以见于慢性萎缩性胃炎的病人，胃癌的病人等等，胃溃疡、十二指肠溃疡往往胃酸分泌是高的，这种病人有可能胃蛋白酶原就都是增高的。所以临床上可以抽血化验胃蛋白酶原，包括1、2以及它的比值来进行一个血清学的活检，不需要进行侵入性的胃镜检查就能够大致了解胃内的这种功能状态。
胃蛋白酶原1它是胃底腺还有粘液颈细胞分泌，胃蛋白酶原2除了这些部位的腺体分泌，还可以是胃窦，幽门腺它们分泌的。所以在肠上皮化生不典型增生，甚至是癌变的时候，胃蛋白酶原2会升高，而胃蛋白酶原1下降，这时候这个比值就会降低，也就是分母大了，分子小了，所以这个数值就是降低的，有助于判断。而且也是临床进行一些治疗以后，疗效判断的一种手段。有一些科研项目就可以观察胃蛋白酶原的变化，现在中医中药治疗萎缩性胃炎也是非常的热门的研究项目，所以也可以进行胃蛋白酶原方面的检测。