苍耳子可能会在用药期间出现一些副作用，尤其是可引起中毒反应，导致患者对外界刺激反应迟钝，呼吸不规则，死前呼吸极度困难，伴有阵发性痉厥.病理组织学检查，肝损害最为严重，即种仁浸剂中毒的主要原因为肝脏坏死，继发的脑组织水肿所致的惊厥，可能为死亡的直接原因。如果服用苍耳子出现中毒的现象，可催吐、洗胃、导泻将体内的毒物都排出体外。催吐后可以服用牛奶或者豆浆。