时差导致的睡眠障碍原因主要是旅行者体内生物节律与所处时区时间不同步，出现不同程度的睡眠使动或睡眠维持困难、嗜睡、警觉性减低以及一些相应躯体症状，躯体症状主要与胃肠道功能紊乱相关。快速的空中旅行跨越几个时区以后，患者内部节律系统仍然指向原时区时间，由于节律系统适应过程慢，所以时差综合征通常会持续几天。