肾结核主要和结核杆菌的感染有关系，患者排出的尿液中存在细菌，可能会感染给旁边的人。血液传播是肾结核最主要的感染途径。结核杆菌也会通过淋巴道播散到肾脏。当尿路发生结核病变后，结核杆菌由尿路回流上升传至肾脏；肾脏附近的器官如脊柱、肠发生结核病变直接扩散蔓延至肾脏。