最直观的检查是粪便常规，可以确定粪便有无血液，白细胞，细菌和病毒，鉴别肠道感染，肠癌。患者主诉如果有消化不良和腹胀，则支持便秘诊断。影像学检查肠道病理学改变，鉴别肠梗阻，肠套叠，肠扭转，巨结肠。肠道菌群检查可以支持菌群紊乱造成的便秘。