1、非手术治疗、饮食调整。以治疗肛门直肠发炎，使大便成形，避免出现腹泻、便秘等情况，消除肛管直肠炎症刺激的不舒服感。
2、肛门括约肌的锻炼。
3、刺激肛门括约肌收缩，对神经肛门失禁者，可以采取针灸的方法进行治疗。
4、使用手术的方法进行治疗，主要针对肛管括约肌的损伤，或者是先天性的高位肛门闭锁术后的肛门失禁，可以采用肛管括约肌修复术，肛管前方括约肌的折叠术进行治疗。