长期低热本身是没有危害的，关键是在于低热的原因，有些原因导致的低热，通常是不会造成明显危害的。比如功能性低热，功能性低热的患者，不存在器质性的病变，对于功能性低热的患者，给予对症的处理以及适当的调节，患者的体温往往会逐渐恢复。
有些原因导致的低热危害是比较大的，比如淋巴瘤或者其他系统的恶性肿瘤，有可能会导致长期低热的情况。对于这些疾病患者的结局可能是比较差的，甚至有可能会在数年内危及到生命。另外，还有一些原因导致的长期低热，也有可能会导致不良的结局，比如结缔组织病导致的长期低热，病人可能会伴随有其他系统的损害，可能会导致肺纤维化，可能会导致肾功能不全等相关的情况，这些也是需要给予积极处理的。
