系统性红斑狼疮的治疗主要是药物治疗，因为它是一种自身免疫性疾病，是免疫系统紊乱所导致的，所以我们治疗主要是针对免疫的治疗，很多人都认为得免疫病那是因为免疫功能低下，所以很多人就问，是不是需要吃一些增强免疫力的药物，这个其实不对，因为系统性红斑狼疮包括我们其它的自身免疫性疾病，它是由于免疫系统紊乱导致，它是不该强的强，所以在治疗上，我们反而是用免疫抑制剂，是要把这些不该强的给它压制住，所以建议大家不要盲目的去用增强免疫的药物，有可能会使疾病进一步的加重。系统性红斑狼疮的药物治疗主要包括以下几种：
第一，糖皮质激素类药物，大家比较反感，激素类的药物副作用非常多，可以引起感染、股骨头坏死、血压升高、血糖升高等等，但是它的正作用也非常多，所以至今糖皮质激素在治疗免疫性疾病当中，尤其是红斑狼疮当中，还是不可替代，通常都是首选药物，尤其在病程的早期，我们会根据患者的病情评估是否是红斑狼疮，红斑狼疮的病情的轻、中、重，我们会进行分级来选用，这个人要不要用糖皮质激素、糖皮质激素的具体用量是多少。
第二，免疫抑制剂，免疫抑制剂也是为达到治疗的效果，尤其是在维持治疗阶段非常重要，它可以缓解病情，维持治疗，尤其在糖皮质激素减量的过程当中，免疫抑制剂对于维持它的治疗，预防复发非常重要，免疫抑制剂常用的也有很多种，也会根据患者的个体差异来进行一个选择。
第三，更新的药物是狼疮现在有生物制剂可以选用，也有一些靶向药物可以选用，比如贝利木单抗、白介素-2也是近几年相对来说比较新的治疗的手段，对于传统的治疗方法效果不好的，控制不住的或者糖皮质激素减量有困难的病人，我们可以考虑用一些新的药物进行治疗。
总的原则是要早期治疗、规范化治疗、长程治疗，治疗好转之后的药物的减量和停用必须遵循医生的医嘱，因为这类疾病它有一个特点，就是非常容易复发，疾病一旦复发以后，我们还要重新评估病情，重新制定治疗方案。