避孕药是为了通过改变女性的生理周期来达到避孕目的，但长期服用避孕药会导致女性闭经。

长期服避孕药会使子宫内膜萎缩，一旦停药后就会有闭经的发生。服用避孕药或者肌注避孕针一个阶段，停药3个月以上，月经不能自行来潮，又排除怀孕者称药后闭经。

避孕药能改变子宫环境，使子宫内膜分泌减少，生长薄，故未能形成完整的一次月经，如果是长效药，因其能抑制子宫内膜的生长而使月经过少，甚至闭经。但这种现象一般是暂时性的，大部分妇女停药后可自动恢复月经。故对原有月经过少、稀发，排卵稀少的未孕妇女不宜使用口服或肌注避孕药法避孕，而应采取其他方法避孕。

避孕药对子宫内膜功能也同样存在抑制作用，长期服用使子宫内膜功能严重受到抑制，不能长到正常厚度，还无法正常周期性规律脱落，导致子宫内膜腺体发育不健全，则容易引起闭经。其实避孕药物对卵巢和子宫内膜的抑制作用是同时进行的，所以年轻女性应尽量避免长期服用，如果长期服用，容易造成卵巢自身功能的下降，导致内分泌功能的失调，激素平衡水平紊乱而引起闭经。