通过筛查被发现的丙型肝炎是轻的，容易被治好。如果没有被筛查发现，而是通过有了症状之后才发现，丙型肝炎就比乙型肝炎要严重。
丙型肝炎和乙型肝炎如果不考虑治疗手段，只是从自然史方面来评估是丙型肝炎更严重。丙型肝炎的发病非常隐匿。乙肝可以在早期表现出肝炎的症状，比如出现浑身无力、吃不下饭、出现黄疸等。而丙肝在早期没有任何表现，只有发展到肝硬化和肝癌之后才会表现出肝硬化和肝癌的很多症状。对于丙肝病人只有通过筛查才能发现早期病人。如果通过症状去发现往往需要到肝硬化和肝癌晚期阶段。
从治疗角度上来讲，现在有根治丙肝的药物，而根治丙肝的药物只需要服用三个月，每天吃一片药就能治好。而乙肝至今为止还没有这样的药物上市，还不能够通过短期治疗得到根治。所以从这个角度来讲，丙型肝炎比乙型肝炎要好得多。乙型肝炎通过症状被发现的时候，往往是在肝炎阶段，而不是在肝硬化和肝癌阶段。虽然没有药物短期根治，需要长期服用药物，在长期服用药物的过程中，也会减少肝硬化、肝癌的发生。