巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，它是指具有生长功能的子宫内膜移位到了患者的卵巢上，移位到卵巢上的子宫内膜会侵犯卵巢的皮质在其内生长，子宫内膜在雌激素以及孕激素周期性的作用下，会发生周期性的增生和剥脱，而剥脱的子宫内膜就会出血，逐渐在卵巢内局部堆积，所以会形成像巧克力一样的囊肿。因为这种囊肿其内的液体为陈旧性的像巧克力一样的液体，所以又叫做巧克力囊肿。巧克力囊肿的女性患者，如果囊肿较小可以没有临床症状的，如果较大时会影响卵巢功能，甚至会引起不孕症的发生。临床上对于巧克力囊肿的患者，如果囊肿过大则需要进行手术切除。

巧克力囊肿治疗方法有手术治疗、药物治疗、放置宫内节育器等，主要是根据患者的年龄、生育要求的综合评估。1、对无生育要求，年龄45岁左右、症状重、病灶累及重要脏器或多种治疗无效者，建议行全子宫双附件切除术根治。双侧卵巢切除后，没有激素的支持，异位的病灶会萎缩退化消失。2、对于年轻要求生育的患者和不孕症患者经全面检查排除其不孕因素，首先应该尽早在腹腔镜下明确诊断，分离盆腔粘连，去除肉眼可见的病灶，恢复正常的解剖结构。保留子宫和卵巢。手术可以明确诊断，排除恶性肿瘤，缓解疼痛，改善生活质量，能显着提高轻度内异症的自然妊娠率。然后药物抑制内异症的残余病灶，改善盆腔的免疫环境，抑制雌激素水平。最后，建议中重度患者尽早积极采用辅助生殖技术助孕。不应长期期待或药物治疗。3、对无生育要求较年轻的患者可以选择腹腔镜手术去除病灶，保留卵巢和子宫，宫内放置曼月乐的方法，曼月乐是一种含有孕激素的宫内节育器，即可以避孕，又可以缓解痛经和月经过多的症状，预防内异症复发。如果没有口服避孕药禁忌症的患者也可以长期服用避孕药。

巧克力囊肿术后打促性腺激素释放激素激动剂6到9个月，用于预防囊肿复发。巧克力囊肿术后复发率较高，为预防囊肿复发，建议术后立即开始用促性腺激素释放激素激动剂（包括达菲林、诺雷德等）连续用药6到9个月。用药期间体内激素水平类似切除双侧卵巢后状态，无月经来潮、不排卵，称为假绝经疗法。异位子宫内膜失去雌激素维持，发生萎缩、凋亡、逐渐消失，达到预防复发作用。停药后可很快恢复排卵和月经周期，就可怀孕，不影响卵巢功能。尤其对于有生育要求的患者更为合适。以上方法副作用较大，主要是骨质疏松和更年期综合征，但对预防复发和生育价值很大。副作用可用“反加疗法”缓解，即补充最小量雌激素，如戊酸雌二醇片，使体内雌激素水平不至于导致严重骨矿物质丢失。

巧克力囊肿术后需要吃孕激素、雄激素类衍生物如合成的17α乙炔睾丸酮（达那唑）、19—去甲睾酮衍生物（孕三烯酮）、促性腺激素释放激素激动剂(GnRHa)、米非司酮等药物。巧克力囊肿是“肿块”但并非是“肿瘤”，是子宫内膜异位症的一种病变。建议经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术、内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。巧克力囊肿术后容易复发，可以选用下列药物预防复发：孕激素、雄激素类衍生物如合成的17α乙炔睾丸酮（达那唑）；19—去甲睾酮衍生物（孕三烯酮）；促性腺激素释放激素激动剂(GnRHa)；米非司酮。建议GnRH或孕三烯酮治疗内异症，但副作用大，易复发。建议看中医吃煎药，成药效果不佳。还有一个方法，假如已经生育，建议放曼月乐环，有治疗内异症作用。

囊肿是长在了卵巢上，常叫卵巢的巧克力，子宫内膜长在了卵巢上，每个月月经的时候卵巢上的子宫内膜会出血，日积月累就形成了囊肿，形成巧克力囊肿。巧克力囊肿常常提示囊肿的内囊内的液体，是陈旧性的出血造成的。很多原因导致巧克力囊肿的囊内出血，最常见的将近接近80%以上的是卵巢的子宫内膜异位症。随着每次月经出血囊肿会长大，长到一定程度以后它可能会出现破裂，是最常见的卵巢的巧克力囊肿是子宫内膜异位囊肿。还有比如卵巢的浆液性或黏性囊肿，也有可能会有囊内的出血，颜色也可能是咖啡色或者是巧克力色。一定要把囊壁剥离下来，在显微镜下去看才能知道到底是什么病，可能是子宫内膜异位症，也可能是一个卵巢的病理性的肿瘤。