急性鼻窦炎的治疗原则以非手术疗法为主，原则上应尽快消除病因，促进鼻窦的通气引流，控制感染，防止并发症的发生。具体又分为药物治疗和手术治疗。
药物治疗，全身的方面主要是抗炎治疗，也就是抗生素治疗。因为急性鼻窦炎多半是一种细菌感染造成的化脓性炎症，因此全身应用抗生素在急性鼻窦炎的治疗中，地位比较重要。因为感染多来自于球菌、杆菌，少部分也来自于厌氧菌，因此抗生素选择首选应该是青霉素类。如果对青霉素过敏，也可以选择二代头孢类的抗生素，要进行足量、全疗程的治疗，通常至少要一周或者可以到两周的时间。
在全身应用抗生素的同时，局部鼻腔也可以有一些药物治疗，比如说生理盐水的灌洗，保证鼻腔的清洁，可以少量使用一些减充血剂类的药物，能够促进窦口的开放，促进引流。还有鼻用的糖皮质激素，因为它具有明显的抗炎和抗水肿的作用，一般急性鼻窦炎可以使用2~4周左右。还有黏液促排剂，它可以稀释鼻腔鼻窦的分泌物，还能促进鼻腔鼻窦黏膜纤毛运动功能，这样能促进分泌物尽快的排出。此外，如果是一些比如合并了其他鼻炎的患者，还可以使用一些抗组胺药物，急性鼻窦炎主要就是以上这些药物治疗。
手术治疗主要用于急性鼻窦炎引发了一些周围器官，尤其是眼眶，甚至颅内的一些并发症的时候，才会考虑使用手术治疗。但近年来随着抗生素的发展，应该说并发症出现的比例越来越小，需要手术治疗急性鼻窦炎的病人也越来越少。